漢置當陽縣。唐貞元二十一年（公元805年）置荊門縣。宋建荊門軍，明復荊門縣，清為荊門直隸州，民國降州為縣。1949年屬荊州專區(qū)，1970年屬荊州地區(qū)。1979年析荊門縣城關鎮(zhèn)及近郊置荊門市，屬荊州地區(qū)。

1983年8月19日，國務院批準荊門市升為地級市。撤銷荊門縣，將荊門縣的行政區(qū)域并入荊門市。1985年，設立荊門市東寶區(qū)、沙洋區(qū)。

1992年5月20日，民政部批準（民行批[1992]48號）撤銷鐘祥縣，設立鐘祥市。

1996年12月2日，國務院批準（國函[1996]111號）將荊州市管轄的京山縣劃歸荊門市管轄和將荊州市代管的鐘祥市劃歸荊門市代管。

1998年12月9日，國務院批準撤銷荊門市沙洋區(qū)，設立沙洋縣?？h人民政府駐地為沙洋鎮(zhèn)。

2001年3月17日，國務院批準（國函[2001]25號）設立荊門市掇刀區(qū)。將荊門市東寶區(qū)的何場鄉(xiāng)、麻城鎮(zhèn)、團林鋪鎮(zhèn)、掇刀石街道和白廟街道劃歸掇刀區(qū)管轄。區(qū)人民政府駐深圳大道。

2001年3月，經省民政廳批準：京山縣撤銷楊鋒鎮(zhèn)劃歸永隆鎮(zhèn)管轄，撤銷馬店鎮(zhèn)劃歸羅店鎮(zhèn)管轄。沙洋縣撤銷草場鄉(xiāng)劃歸五里鎮(zhèn)管轄，撤銷蛟尾鎮(zhèn)劃歸后港鎮(zhèn)管轄，撤銷蔡廟鄉(xiāng)劃歸曾集鎮(zhèn)管轄，煙垢鎮(zhèn)改名為高陽鎮(zhèn)。鐘祥市撤銷中山鎮(zhèn)劃歸洋梓鎮(zhèn)管轄，撤銷潞市鎮(zhèn)劃歸豐樂鎮(zhèn)管轄，撤銷賀集鄉(xiāng)劃歸石牌鎮(zhèn)管轄，撤銷羅集鎮(zhèn)劃歸舊口鎮(zhèn)管轄，撤銷磷礦街辦設立磷礦鎮(zhèn)，撤銷轉斗鎮(zhèn)和胡集街辦設立胡集鎮(zhèn)。東寶區(qū)撤銷安團鄉(xiāng)，劃歸漳河鎮(zhèn)管轄，撤銷姚河鄉(xiāng)劃歸栗溪鎮(zhèn)管轄，撤銷何場鄉(xiāng)，將原從煙墩鎮(zhèn)劃入的9個村劃歸漳河鎮(zhèn)管轄，原從團林鋪鎮(zhèn)劃入的15個村劃歸團林鋪鎮(zhèn)管轄。 2001年4月，經國務院批準，設立掇刀區(qū)。省政府對我市行政區(qū)劃進行了相應調整，將原東寶區(qū)所屬掇刀街辦、白廟街辦、團林鋪鎮(zhèn)、麻城鎮(zhèn)劃歸掇刀區(qū)管轄。 截止2001年6月，全市轄4個街道、49個鎮(zhèn)、4個鄉(xiāng)，1536個村委會。其中，京山縣轄新市、永興、曹武、羅店、宋河、坪壩、三陽、綠林、孫橋、永隆、雁門口、錢場、石龍、楊集14個鎮(zhèn)；沙洋縣轄沙洋、五里鋪、十里鋪、紀山、拾回橋、后港、毛李、官當、李市、馬良、高陽、沈集、曾集13個鎮(zhèn)；鐘祥市轄郢中、洋梓、長壽、豐樂、胡集、雙河、磷礦、文集、冷水、石牌、舊口、柴湖、長灘、東橋、客店、張集16個鎮(zhèn)和九里回族鄉(xiāng)；東寶區(qū)轄栗溪、馬河、子陵鋪、漳河4個鎮(zhèn)，仙居、石橋驛、牌樓3個鄉(xiāng)和龍泉、泉口2個街道辦事處；掇刀區(qū)轄團林鋪、麻城2個鎮(zhèn)，掇刀、白廟2個街道辦事處。全市有村民委員會1536個，村民小組10906個。全市國土面積12404平方千米，占全省國土面積6.67%。其中，京山縣3284平方千米，占全市國土面積26.48%；沙洋縣1999平方千米，占全市國土面積16.12%；鐘祥市4488平方千米，占全市國土面積36.18%；東寶區(qū)1528平方千米，占全市國土面積12.32%；掇刀區(qū)643平方千米，占全市國土面積5.18%；屈家?guī)X管理區(qū)220平方千米，占全市國土面積1.77%；沙洋監(jiān)獄管理局242平方千米，占全市國土面積1.95%。

2004年底，全市轄5個街道、50個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)，153個居委會、1501個村委會。面積12045平方千米，總人口2848410人。