根據(jù)上述職責，海珠區(qū)法院機關(guān)內(nèi)設(shè)16個機構(gòu)。

(一)辦公室

協(xié)助院領(lǐng)導(dǎo)組織、協(xié)調(diào)、處理有關(guān)司法政務(wù)，管理有關(guān)事務(wù)；督辦院黨組會議、院長辦公會議決定事項和領(lǐng)導(dǎo)交辦的事項以及區(qū)人大代表建議、議案和區(qū)政協(xié)委員提案；負責與區(qū)人大代表聯(lián)絡(luò)工作；負責院黨組會議、院長辦公會議會務(wù)工作；負責院審判委員會會務(wù)及日常工作；負責院重要會議和重大活動的組織協(xié)調(diào)工作；負責院印章管理和收發(fā)及司法檔案的收集、管理工作；負責文件、電報的收發(fā)、傳閱、交換和保密工作；負責起草綜合性文件、報告、簡報、情況反映等工作；負責院計算機網(wǎng)絡(luò)、辦公現(xiàn)代化計劃和管理工作；負責管理院各項經(jīng)費和國有資產(chǎn)工作。

(二)立案庭（掛海珠區(qū)人民法院信訪辦公室牌子）

負責院各類案件的立案和審判流程管理；審查不服本院生效裁判的各類申訴和再審申請和再審改判的或未經(jīng)復(fù)查、再審的申訴、再審申請，決定是否立案；審查訴前及立案階段的財產(chǎn)、證據(jù)保全申請并作出裁定，執(zhí)行財產(chǎn)、證據(jù)保全裁定,收轉(zhuǎn)各類訴訟資料，送達相關(guān)的法律文書；核算訴訟費，辦理訴訟費的緩、減、免手續(xù)；負責信訪和司法救助申請事宜。

(三)刑事審判庭

審理法律規(guī)定由基層人民法院管轄的第一審普通刑事案件或由上級人民法院指定審判的其他刑事犯罪案件。

(四)民事審判第一庭

審判法律規(guī)定由基層人民法院管轄的有關(guān)婚姻家庭、勞動爭議、不當?shù)美?、無因管理等傳統(tǒng)民事案件；自然人之間、自然人與法人、其他組織之間的合同、侵權(quán)案件。

(五)民事審判第二庭

審判法律規(guī)定由基層人民法院管轄的法人之間、法人與其他組織之間的合同糾紛、侵權(quán)糾紛案件；審判證券、期貨、票據(jù)、股權(quán)等案件。

(六)民事審判第三庭

審判法律規(guī)定由基層人民法院管轄的房地產(chǎn)案件（包括房屋買賣、租賃、預(yù)售、按揭、開發(fā)、物業(yè)管理等房地產(chǎn)糾紛案件）。

(七) 民事審判第四庭

負責審理由本院管轄的涉外一審民事和涉港澳臺的商事糾紛案件。審理發(fā)生在轄區(qū)內(nèi)除專利、植物新品種、集成電路布圖設(shè)計糾紛案件之外的，且案件爭議金額不滿人民幣200萬元，案情簡單，社會影響不大的一審知識產(chǎn)權(quán)民事糾紛案件。

(八)行政審判庭

審判法律規(guī)定由基層人民法院管轄的第一審行政案件和行政賠償案件；審查行政機關(guān)申請強制執(zhí)行其具體行政行為的案件。

(九)審判監(jiān)督庭

審查處理本院已經(jīng)發(fā)生法律效力、經(jīng)立案庭審查認為符合立案條件的各類審判監(jiān)督案件；審查處理院領(lǐng)導(dǎo)、上級領(lǐng)導(dǎo)機關(guān)交辦的、不服生效裁判的刑事、民事、行政審判監(jiān)督案件；負責全院各類案件的監(jiān)督、分析、評查，及提出錯案追究建議；負責國家賠償?shù)拇_認工作。

(十)少年審判庭

審理未成年人的刑事案件，包括被告人為未成年人的或被害人為未成年人的刑事附帶民事訴訟案件；未成年人為首犯、主犯的共同犯罪案件；共同犯罪案件中未成年被告人達到一半以上的刑事案件；負責審理當事人一方或雙方為未成年人的民事案件，以及婚姻家庭、繼承糾紛案件中涉及未成年人權(quán)益的案件；審理當事人為未成年人的行政訴訟案件；審理最高人民法院和省級人民法院指定的其他區(qū)域的未成年人的案件；開展青少年法制教育和學(xué)術(shù)研究交流，參與社會治安綜合治理等工作。

(十一)執(zhí)行局

執(zhí)行人民法院已發(fā)生法律效力的判決、裁定和決定以及法律規(guī)定應(yīng)當由本院執(zhí)行的其他法律文書，執(zhí)行外地法院依法委托執(zhí)行的事項。

(十二)調(diào)研科

負責院重大工作部署的調(diào)查研究工作；編寫內(nèi)部刊物，起草工作計劃、總結(jié)、工作報告、會議材料及其他重要文件；負責司法統(tǒng)計；研究、征集對法律、法規(guī)、規(guī)章草案的意見；負責聯(lián)系新聞媒體，聯(lián)系和接待采訪法院工作的記者；管理圖書、報刊資料。

(十三)監(jiān)察室（與紀檢組合署辦公）

負責紀檢、監(jiān)察工作；監(jiān)督、檢查本院及其工作人員執(zhí)行國家法律、法規(guī)、政策及工作紀律的情況；受理對本院及其工作人員違法違紀行為的檢舉、控告；負責法院審判人員違法審判追究工作；查處本院及其工作人員的違法違紀行為。

(十四)政工辦公室

負責本院思想政治工作、隊伍建設(shè)；負責本院各類人員的考錄、任免、調(diào)配、工資福利、公費醫(yī)療、計劃生育、教育培訓(xùn)、考試考核、離退休干部管理服務(wù)等工作；管理人事檔案、采集分析人事信息，組織落實各項組織人事和機構(gòu)編制工作制度；負責本院宣傳教育，黨員、黨務(wù)管理工作；負責法官等級評定和司法警察警銜的有關(guān)工作。

(十五)司法警察大隊

執(zhí)行司法警察工作的條例、規(guī)定、辦法；實施司法警察管理的規(guī)章制度；負責押解人犯、開庭審判值庭和協(xié)助執(zhí)行發(fā)生法律效力的判決、裁定和財產(chǎn)保全等任務(wù)；負責檢查、監(jiān)察本院槍支、彈藥的使用；接受上級司法警察機構(gòu)的調(diào)遣；協(xié)助有關(guān)本院機關(guān)的安全保衛(wèi)工作。

(十六)后勤服務(wù)中心

海珠區(qū)法院后勤服務(wù)中心，為區(qū)法院管理的科級事業(yè)單位。負責法院機關(guān)、直屬和派出單位的物業(yè)管理、公務(wù)用車、文印、衛(wèi)生、綠化等后勤保障管理和其他輔助性、服務(wù)性工作。